Lần bắt thứ hai năm 1940 và sự quy chụp tàn bạo của kẻ thù
Âm mưu của thực dân Pháp nhằm tiêu diệt nhà lãnh đạo kiệt xuất sau Khởi nghĩa Nam Kỳ.
Tháng 1 năm 1940, lo sợ trước vai trò và uy tín của Lê Hồng Phong, thực dân Pháp lại bắt ông lần thứ hai tại Nghệ An và giải vào Sài Gòn giam giữ.
Đến tháng 11 năm 1940, Cuộc khởi nghĩa Nam Kỳ bùng nổ. Dù Lê Hồng Phong đã bị giam giữ từ trước đó gần một năm và hoàn toàn không thể trực tiếp chỉ đạo cuộc khởi nghĩa, thực dân Pháp vẫn quy chụp ông tội "chịu trách nhiệm tinh thần" cho sự kiện này để lấy cớ tiêu diệt ông.
Chúng kết án ông 5 năm tù giam và 10 năm quản thúc. Ngay sau đó, nhận thấy Lê Hồng Phong là một nguy cơ to lớn nếu còn sống, thực dân Pháp đã quyết định đưa ông ra đày tại "địa ngục trần gian" Côn Đảo – nơi chúng dùng chế độ giam giữ khắc nghiệt nhất để hủy hoại sức khỏe của ông.



