Ở bên cạnh Chủ tịch Hồ Chí Minh trong những ngày toàn quốc kháng chiến
Khi cuộc kháng chiến toàn quốc bùng nổ, Bùi Bằng Đoàn được giao ở bên cạnh Chủ tịch Hồ Chí Minh và Chính phủ. Từ đó, ông tiếp tục thực hiện vai trò góp ý kiến, tham gia công việc kháng chiến và duy trì hoạt động của cơ quan lập pháp.
Cuối tháng 12/1946, sau khi cuộc kháng chiến toàn quốc chống thực dân Pháp bùng nổ, Ban Thường trực Quốc hội họp và thống nhất phương án tổ chức hoạt động trong điều kiện chiến tranh.
Theo quyết định của Ban Thường trực, Bùi Bằng Đoàn – với tư cách Trưởng ban – ở cùng Chính phủ để giúp và theo dõi đường lối chính trị, cùng Chính phủ chỉ đạo cuộc kháng chiến toàn dân, toàn diện. Các đại biểu Quốc hội tùy theo năng lực và địa vị tham gia những công việc kháng chiến.
Từ đó, ông thường xuyên ở bên cạnh Chủ tịch Hồ Chí Minh và tham dự các cuộc họp của Hội đồng Chính phủ để góp ý kiến. Tư liệu về hoạt động của Chủ tịch Hồ Chí Minh với Quốc hội cũng ghi nhận việc Chủ tịch Hồ Chí Minh căn cứ vào Hiến pháp để triệu tập cuộc họp với Trưởng ban Thường trực Quốc hội Bùi Bằng Đoàn và Hội đồng Chính phủ trong thời điểm quyết định phát động toàn quốc kháng chiến.
Đây là một giai đoạn thể hiện rõ vai trò của Bùi Bằng Đoàn: dù hoạt động trong hoàn cảnh chiến tranh, ông vẫn tiếp tục thực hiện chức năng góp ý kiến, giám sát và phối hợp giữa Quốc hội với Chính phủ.
