Từ người chỉ huy Trung đoàn Vàm Cỏ đến cán bộ tham mưu Quân khu 7
Sau thời gian trưởng thành từ cơ sở và thực tiễn chiến trường, Thượng tướng Trần Đơn từng bước đảm nhiệm các cương vị chỉ huy, tham mưu quan trọng. Đặc biệt, thời gian công tác tại Bộ Tham mưu Quân khu 7 đã giúp ông tích lũy thêm kinh nghiệm trong tổ chức, chỉ huy và tham mưu các nhiệm vụ quân sự trên địa bàn rộng lớn.
Tháng 11/1989, đồng chí Trần Đơn về nhận công tác tại Trung đoàn Vàm Cỏ. Tại đây, đồng chí lần lượt giữ cương vị Phó Trung đoàn trưởng - Tham mưu trưởng từ tháng 11/1989 đến tháng 4/1990, Quyền Trung đoàn trưởng từ tháng 5 đến tháng 9/1990, sau đó là Trung đoàn trưởng đến tháng 7/1994.
Việc đảm nhiệm liên tiếp các cương vị chỉ huy tại Trung đoàn Vàm Cỏ là bước phát triển quan trọng trong quá trình công tác của đồng chí. Từ người cán bộ tham mưu, đồng chí từng bước đảm nhiệm trách nhiệm chỉ huy cao hơn, đồng thời kết hợp công tác thực tiễn với quá trình đào tạo tại Học viện Lục quân và Học viện Quốc phòng.
Từ tháng 1 đến tháng 5/1997, đồng chí được bổ nhiệm Phó Tham mưu trưởng Bộ Chỉ huy Quân sự tỉnh Long An. Tháng 6/1997, đồng chí về công tác tại Bộ Tham mưu Quân khu 7 với cương vị Phó Trưởng phòng Tác chiến.
Từ tháng 6/1998 đến tháng 6/1999, đồng chí giữ cương vị Trưởng phòng Tác chiến. Từ tháng 7/1999, đồng chí đảm nhiệm Phó Tham mưu trưởng Quân khu và có thời gian kiêm Trưởng phòng Tác chiến từ tháng 10/2000 đến tháng 8/2001.
Những cương vị liên tiếp trong lĩnh vực tác chiến và tham mưu đã giúp đồng chí có điều kiện tiếp cận, xử lý các nhiệm vụ quân sự ở tầm rộng hơn, từ cấp đơn vị đến cấp Quân khu. Đây là một bước trưởng thành quan trọng trước khi đồng chí đảm nhiệm những trọng trách cao hơn trong lực lượng vũ trang Quân khu 7.
